Misterioso ‘gen dentro de un gen’ encontrado en SARS-CoV-2

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Los investigadores descubrieron un gen misterioso en el código del coronavirus SARS-CoV-2. Hasta ahora, el segmento era invisible para el ojo humano.

El gen se llamó ORF3d y es lo que se conoce como superpuesto: una especie de gen dentro de un gen, que está oculta en una cadena de nucleótidos debido a la forma en que se superpone con las secuencias codificadas de otros genes.

“En términos de tamaño del genoma, el SARS-CoV-2 y sus parientes se encuentran entre los virus de ARN existentes más grandes”, explica la bioinformática Chase Nelson, del Museo Americano de Historia Natural.

Es muy probable que los virus alberguen genes superpuestos, pero en un virus que tiene solo unos 15 genes conocidos, el descubrimiento de uno más es un avance significativo.

Los genes superpuestos son difíciles de identificar en secuencias genéticas, ya que los sistemas de escaneo genómico a menudo no pueden detectarlos cuando cruzan las cadenas del código genético. Es porque están programados para captar genes individuales, pero sin necesariamente ver los planos generales. En el contexto de un virus como el SARS-CoV-2, esto puede ser un punto ciego serio.

“Ignorar los genes superpuestos nos pone en riesgo de ignorar aspectos importantes de la biología viral. Los genes superpuestos pueden ser una de las formas en que los coronavirus han evolucionado para replicarse de manera eficiente, prevenir la inmunidad del huésped o transmitirse”, enfatiza Nelson. . .

Una cosa que se sabe sobre el gen misterioso es que ORF3d provoca una fuerte respuesta de anticuerpos, pero si los linfocitos T también se activan o para qué otros propósitos esto aún debe investigarse, concluyen los científicos en su reporte para eLife.

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